Dopo la distruzione del Muro del Lamento che separa gli Inferi dall'Elisio per mano dei Cavalieri d'oro, Ioria di Leo si ritrova nei pressi di Asgard dove delle guardie lo scambiano per un ubriaco e lo conducono in prigione. Nel frattempo, nello stesso villaggio la giovane Lithia (dama di compagnia di Ilda di Polaris e Flare) cerca di convincere i paesani a ribellarsi al volere delle guardie del palazzo, che poco dopo fanno irruzione e la conducono in prigione, dove incontra il Cavaliere del Leone. Una volta evasi la giovane chiede a Ioria di aiutarla a salvare la sua terra dagli inganni messi in atto dal nuovo celebrante di Odino, Andreas Liese. Succeduto a Ilda dopo che questa è stata colpita da uno strano malore, Andreas ha riportato in vita l'albero proibito Yggdrasil e ricostituito l'ordine dei Cavalieri di Asgard.
Ioria (desideroso di tornare negli inferi per aiutare Atena e di scoprire il perché della sua resurrezione) inizialmente rifiuta di aiutare Lithia, ma quando la ragazza viene catturata dal Cavaliere di asgard Frodi di Gullinbursti torna indietro per salvarla, solo per essere subito messo in difficoltà dal potere dell'albero Yggdrasil che assorbe i cosmi nemici potenziando quelli dei Cavalieri di Asgard. Dopo avere capito che il suo avversario è tornato in vita come Einherjar (un guerriero risorto dopo essere morto una volta) per via dei simboli violacei apparsi sul corpo del Cavaliere di Atena, Frodi si appresta a finire il nemico ma in quel momento il ciondolo di Ioria si illumina, trasmettendo a tutti e dodici i Cavalieri d'Oro risorti ad Asgard un messaggio di Micene: devono raggiungere l'Yggdrasll per scoprire il mistero della propria rinascita. La Sacra Armatura del Leone subisce una mutazione temporanea grazie alla quale Ioria riesce a sconfiggere il nemico, per poi essere portato via da Lithia. Prima di ritirarsi con i suoi soldati Frodi scorge una strana presenza all'interno della ragazza.
Poco distante Mur dell'Ariete percepisce il potere della trasformazione dell'armatura di Ioria, e si domanda se non si tratti di una Kamui, un'armatura divina.

Dopo lo scontro con Frodi, Lithia porta l'indebolito Ioria al riparo in una casa disabitata non molto distante, dove però non vi sono viveri. La giovane si reca a cercarli nel villaggio vicino, che però è inspiegabilmente deserto e lì perde i sensi per il freddo. Viene però salvata da Mur, che la porta nel fienile appartenente ai genitori dell'unico bambino rimasto al villaggio. Dopo essersi ripresa e avere ascoltato i racconti del piccolo, Lithia capisce che la causa della scomparsa degli abitanti è il sadico Cavaliere di Asgard Fafner di Nidhogg, che sta conducendo degli esperimenti su cavie umane nella cattedrale del villaggio e che molto probabilmente gli abitanti sono lì.
Il Cavaliere dell'Ariete si reca dunque alla cattedrale, dove viene catturato e torturato dal nemico. In seguito Mur si libera asserendo di avere solo finto di essere in svantaggio allo scopo di capire l'entità degli esperimenti di Fafner e di analizzare l'Yggdrasil da vicino, nonché di dare così tempo a Lithia e Ioria di arrivare al villaggio in modo da costringere Fafner alla fuga e liberare gli abitanti del villaggio.
Nel frattempo Aldebaran giunge in un'arena dove Dohko di Libra si sta scontrando con degli avversari asgardiani dinanzi a un pubblico. Mentre si interrogano sulla loro misteriosa rinascita, giunge lì il cavaliere Heracles di Tanngrisnir, che istiga i due Cavalieri di Atena a battersi con lui. Dohko propone ad Aldebaran di battersi, anche per rifarsi della sconfitta subita in passato per mano dei cavalieri asgardiani Mizar e Alcor.
Aldebaran quindi scende in campo con la sua armatura, ma inizialmente si rifiuta di combattere una battaglia per scopi personali, dato che ciò è contro il volere di Atena. Solo quando Heracles, per provocarlo, mette in pericolo due bambini che stavano osservando lo scontro, il Cavaliere d'Oro ricorre al Sacro Toro, costringendo Heracles alla ritirata e rigenerando temporaneamente il corno destro dell'elmo della sua armatura d'oro.
Mur rivela a Ioria e Lithia che all'interno dell'Yggdrasil sta crescendo un'entità maligna e insieme al compagno decide di recarsi all'albero in cerca di una risposta. Spinti dal messaggio di Micene anche Aldebarann e Dohko hanno preso la stessa decisione.

Milo di Scorpio sta vagando per Asgard in cerca di risposte quando si imbatte in Camus di Aquarius, il quale ha scelto di schierarsi dalla parte di Asgard per mantenere la promessa fatta da bambino al suo amico Surt di Eikthrynir, uno dei sette Cavalieri di Asgard scelti da Andreas. Camus e Surt attaccano il Cavaliere dello Scorpione facendolo precipitare in un dirupo, dove viene salvato da Shaka di Virgo.
Malgrado le ferite, Milo è deciso ad affrontare in combattimento Camus e a punirlo per il suo tradimento. Si reca quindi al castello dei cavalieri di Asgard, dove oltre a scontrarsi con Camus e Surt affronta anche Sigmund di Grani (fratello di Orion, Cavaliere di Asgard della stella Duhbe). Messo in difficoltà dagli stratagemmi del Cavaliere di Eikthrynir, Milo viene salvato dall'arrivo inaspettato di Saga di Gemini.
Nel frattempo Mur decide di separasi da Ioria e Lithia per andare a cercare Shaka e chiedergli informazioni sulla trasformazione dell'armatura del Leone.
Il Cavaliere del Leone e l'ancella di Ilda arrivano quindi in una città che sembra beneficiare degli effetti della prosperità data alla terra dall'Yggdrasil. In questa città si trovano anche Death Mask di Cancer e Afrodite di Fish. Ioria e Lithia incontrano Death Mask, che sembra più interessato al gioco d'azzardo e all'alcol che a compiere il proprio dovere di cavaliere, la qual cosa scandalizza Lithia. Death Mask si rifiuta di unirsi a loro nella battaglia contro Yggdrasil e Ioria e Lithia lasciano la città.

Dato lo svantaggio numerico Saga decide di abbandonare lo scontro insieme a Milo, non prima di avere distrutto la base di Camus, Surt e Sigmund. I due Cavalieri di Asgard si recano a fare rapporto ad Andreas. Nel frattempo Lithia descrive a Ioria le caratteristiche dei sette guerrieri (Frodi di Gullinbursti, Heracles di Tanngrisnir, Surt di Eikthrynir, Sigmund di Gran, Baldr di Hraesvelg, Utgard di Garm e Fafnir di Nidhogg).
In città Death Mask è ancora intento a giocare d'azzardo in una taverna. Viene rivelato che egli fa segretamente dono dei soldi che vince a Helena, una giovane di cui si è invaghito. Helena, pur essendo malata gestisce un negozio di fiori grazie al quale mantiene se stessa e i suoi fratellini. Death Mask apprende dal sostituto dell'oste che il padrone del locale è all'ospedale a curarsi poiché (su disposizione di Andreas) sembra che chiunque possa farsi visitare gratuitamente.
L'indomani mattina il cavaliere scopre che anche Helena è stata portata in ospedale da un Cavaliere di Asgard per guarirla. Si tratta di Fafner, il quale sta in realtà usando l'energia vitale degli abitanti ricoverati per creare un nuovo zaffiro.
Insospettito, Death Mask si reca all'ospedale pur essendo privo di armatura (l'armatura di Cancer infatti non l'ha ancora riconosciuto come degno di indossarla nuovamente, dopo gli avvenimenti dello scontro con Sirio nella serie classica). Afrodite giunge però nella struttura prima dell'amico e combatte contro il Cavaliere di Asgard con i propri fiori, approfittandone per raccogliere informazioni che invia a Mur. Prima di potere liberare tutti i prigionieri, il Cavaliere viene però attaccato da Andreas e dalle radici da lui controllate. Riesce a portare via dall'ospedale solo Helena, un attimo prima di essere trafitto e risucchiato dalle radici dell'albero davanti agli occhi di Death Mask, sopraggiunto in quel momento.
Death Mask si dichiara pronto ad affrontare Andreas anche privo di armatura e il suo coraggio gli permette di ottenere il perdono dell'armatura, che viene in suo soccorso. Indossatala, il cavaliere d'oro si scontra con Andreas, riuscendo brevemente a trasformare l'armatura come avvenuto a Ioria. Andreas abbandona lo scontro, ma purtroppo Helena spira tra le braccia di Death Mask.

Shaka spiega a Mur il modo per spezzare la barriera dell'Yggdrasill distruggendo le tre grandi radici dell'albero e gli rivela il segreto delle armature divine, consegnandogli inoltre il pugnale usato da Lady Isabel per suicidarsi e scendere negli Inferi (misteriosamente ritrovato accanto a lui): per evocare l'armatura divina è necessaria la presenza di qualcosa legato ad Atena come il pugnale, come il ciondolo di Micene (che egli donò alla piccola Isabel e che da questa fu restituito al Cavaliere di Leo dopo la battaglia al Grande tempio) o come le armature dei Cavalieri d'Oro caduti durante le battaglie al Grande tempio e contro Poseidone, sulle quali Atena versò le proprie lacrime. Questa trasformazione però dura solo pochi minuti.
Mur condivide quindi le informazioni con i Ioria, Milo, Dohko e Aldebaran che si dirigono verso le tre diverse radici, ritrovandosi però a combattere davanti a delle ombre dei Cavalieri di Bronzo generate dalla Inverno di Fimbul, un labirinto posto a guardia delle radici che confonde il cuore degli uomini. Milo, Aldebaran e Dohko sfoderano i loro attacchi migliori sbaragliando le illusioni, mentre l'illusione che Ioria sta affrontando cambia aspetto, assumendo quello di Shura di Capricorn, segno che il Cavaliere del Leone non ha ancora perdonato quello del Capricorno per l'uccisione di Micene. L'illusione sta per avere la meglio ma Ioria viene salvato dall'intervento del vero Shura che gli offre l'occasione di distruggere definitivamente l'ombra.
Giunti davanti alle radici i Cavalieri d'Oro devono fare raggiungere alle armature lo stato divino per poterle distruggere, ma Milo ha bisogno del pugnale e così convince Mur a inviarglielo, ben sapendo di stare mettendo la propria vita in pericolo perché non ancora ripresosi dalle ferite ricevute nello scontro con Camus e Surtr.
Milo, Aldebaran e Ioria raggiungono quindi contemporaneamente lo stadio divino e distruggono le radici, ma il Cavaliere dello Scorpione esala il suo ultimo respiro e viene subito risucchiato dalle radici dell'Yggdrasil.

Distrutte le radici i Cavalieri d'Oro e Lithia si addentrano all'interno delle radici dell'Yggdrasil, ritrovandosi così al centro dell'albero. Qui Lithia rivela che Yggdrasill sta in piedi grazie a sette statue poste in altrettante sale, ognuna protetta da un Cavaliere di Asgard: Svartalfheim (stanza della saggezza), Jotunheim (stanza dei giganti), Alfheim (stanza della luce), Hellheim (stanza della morte), Vanaheim (stanza del coraggio), Niflheim (stanza della nebbia) e infine la Jaheim (la stanza del ghiaccio). I Cavalieri d'Oro si dividono e si recano ognuno in una stanza diversa, mentre Lithia inizia a vagare e si ritrova all'improvviso dentro Hellheim.
Contemporaneamente Andreas dona ai suoi Cavalieri sette nuovi zaffiri per aiutarli a superare la forza dei nemici e facendo loro credere che il ritorno di Ioria e gli altri alla vita è frutto di un'alleanza fra Ade e Atena, inoltre successivamente rivela a Frodi di avere già incontrato personalmente uno dei cavalieri di Atena: Micene di Sagitter, il quale riuscì solamente a ferire il suo occhio sinistro con una freccia, prima di precipitare sconfitto in un dirupo.
Una volta raggiunta ognuno la propria stanza Ioria si trova ad affrontare Frodi nella stanza dell'Eroe, Aldebaran finisce nella stanza del Gigante presieduta da Heracles, Mur incontra nuovamente Fafnir nella stanza della Saggezza, Shura fronteggia Camus in quella del Ghiaccio, mentre Dohko arriva nella stanza dei Morti dove gli si para innanzi una misteriosa figura incappucciata.
Mentre Shaka, Saga e Death Mask si incamminano verso l'Yggdrasil, Andreas percepisce un rallentamento nella crescita dell'albero che parrebbe dovuto alla freccia scoccata da Micene.

Intrapresa la battaglia contro i rispettivi avversari, i Gold Saint si rendono conto dell'incredibile potenza dei sette Zaffiri di Odino. Nella Stanza della Morte, Dohko capisce di stare scontrandosi contro guerrieri già deceduti in passato: li sconfigge facilmente, ma prima che possa attaccare la figura incappucciata Utgard di Garm si para dinanzi a lui, impedendogli di avvicinarsi a essa e alla statua. L'individuo misterioso si libera del cappuccio, rivelandosi come Lithia.
Intanto, nella Stanza del Ghiaccio, Shura e Camus si affrontano arrivando ad attivare la trasformazione delle loro armature in God Cloth. Dopo un scontro tra l'Excalibur e l'Aurora Execution è Camus ad avere la meglio. Surt, il vero guardiano della stanza, si domanda come mai Camus sia ancora in piedi e quest'ultimo gli fa notare che il vero bersaglio dell'attacco di Shura non era lui bensì la Statua del Ghiaccio, che infatti cade in frantumi. Senza esitazione Surt uccide Shura trafiggendolo con la spada e rivela a Camus che la Stanza del Ghiaccio era solo un diversivo per nascondere la Stanza del Fuoco, Muspelheim. Il corpo di Shura viene immediatamente assorbito dalle radici di Yggdrasil. Sconvolto dalla morte dell'antico compagno di battaglia, Camus si rende conto che Surt è ormai votato al male e cerca di farlo rinsavire ma il Cavaliere di Asgard accusa Camus di tradimento e lo attacca, solo per essere sconfitto dall'Aurora Execution di Camus, potenziata dalla God Cloth. In punto di morte Surt si pente delle proprie azioni e Camus accetta le sue scuse. I due cavalieri vengono seppelliti dal crollo della stanza.
Nella Stanza del Gigante, Aldebaran sconfigge Heracles usando il potere del God Cloth. Heracles viene attaccato dalle radici di Yggdrasil e nel tentativo di salvare l'avversario Aldebaran viene risucchiato a sua volta dall'albero sacro, non prima però di avere distrutto la Statua del Gigante. In coda all'episodio, Shaka si prepara ad affrontare Baldr di Hraesvelg nella stanza da lui presieduta, e Andreas, che sta osservando tutti gli scontri a distanza, commenta che il cavaliere della Vergine sta per affrontare un dio.

Shaka attacca Baldr con il Rikudo Rinne e poi con gli spiriti infernali, ma Baldr neutralizza entrambi gli attacchi senza difficoltà e a sua volta attacca Shaka con il suo colpo Ansur. Il Cavaliere della Vergine si difende con il khan e, scioccato, riesce a percepire che il suo avversario ha davvero poteri pari a quelli di un dio. Baldr narra a Shaka di avere ricevuto poteri divini quando, disperato per non avere potuto aiutare gli abitanti del suo villaggio a causa della propria debolezza, elevò preghiere dinanzi a una statua di Odino e il dio gli rispose, concedendogli un corpo invulnerabile. Baldr decise dunque che il luogo più adatto per esercitare il proprio potere era il campo di battaglia, e dopo l'ascesa di Andreas divenne Cavaliere di Hraesvelg. Shaka afferma di avere ricevuto da Atena la conoscenza che la divinità per la quale Andreas combatte non è Odino, che nemmeno la forza che ha donato a Baldr l'invulnerabilità era Odino, e che accettando quel potere Baldr ha perso qualcos'altro di molto importante: la compassione. I due si scontrano ancora e Baldr viene infine sconfitto dal Sacro Virgo di Shaka, che ottiene l'armatura divina e distrugge la statua. In punto di morte, Baldr inizia a provare il dolore che il suo corpo avrebbe dovuto sentire in tutti i precedenti scontri, ma Shaka misericordiosamente lo priva del senso del tatto. La stanza crolla, seppellendo Shaka e Baldr. Nel frattempo Mur si trova in difficoltà con Fafnir e quest'ultimo gli spiega che è diventato così potente grazie ai zaffiri di Odino e agli esperimenti che ha compiuto con essi sulle sue cavie umane. Lo scontro viene interrotto da Death Mask che dice a Mur di andare avanti verso la prossima stanza, mentre lui affronta Fafnir mandandolo nel limbo con il Sekishiki Meikaiha. Fafnir afferma che se lui muore anche i fratelli e le sorelle di Helena moriranno, perché in questo momento stanno venendo utilizzati da lui come fonte di energia. Death Mask però sente le anime dei bambini incoraggiarlo a combattere. La sua armatura raggiunge lo stadio di armatura divina e Death Mask utilizza una nuova tecnica, la Calamità dell'Oltretomba, per intrappolare Fafnir nel limbo senza ucciderlo, in modo che le anime dei bambini possano tornare ai loro corpi. Death Mask distrugge la statua, per poi crollare a terra esausto.
Intanto, Dohko si rende conto che Lithia è posseduta da qualcosa. La fanciulla abbandona la stanza della morte, Dohko cerca di inseguirla ma viene fermato da Utgard di Garm. In coda all'episodio Saga arriva nella stanza della nebbia, pronto ad affrontare Sigmund.

Saga e Sigmund si affrontano e durante la battaglia Sigmund rivela come, essendo stato l'unico a rendersi conto che Ilda era stata posseduta dall'Anello di Nettuno, sia stato da lei imprigionato e Siegfried abbia preso il suo posto come Cavaliere di Asgard per essere poi ucciso nello scontro con i cavalieri di Atena. Sigmund è quindi deciso a vendicare la sorte del suo fratello minore. Saga gli dice che anche lui conosce il dolore della perdita di un fratello. La sua Esplosione Galattica sembra avere la meglio su Sigmund, ma all'improvviso una parte dell'armatura di Siegfrid appare e lo protegge. L'armatura sta piangendo, e Sigmund si rende conto che suo fratello desidererebbe che la battaglia avesse termine. Andreas però interviene, utilizzando il zaffiro per risvegliare in Sigmund il Berserk, uno stato di furia incontrollabile. Incapace di controllarsi, Sigmund attacca Saga, ma il cavaliere d'oro ottiene l'armatura divina e sconfigge l'avversario, risparmiandogli però la vita. Nel frattempo Dohko si scontra con Utgard. Il cavaliere di Odino viene scagliato dalla forza dell'attacco di Dohko contro la statua della stanza della morte che viene distrutta dall'urto con sorprendente facilità, al punto che Dohko si domanda se Utgard non l'abbia fatto apposta. Il colpo inoltre fa cadere la maschera di Utgard, mostrando che egli ha sul volto un marchio simile a quello dei cavalieri d'oro risvegliati dalla morte. Dohko viene travolto dal crollo della stanza. Lo scontro tra Ioria e Frodi viene interrotto da Lithia, che rivela di avere infine ricordato di essere stata lei a riportare in vita i cavalieri d'oro. Per tale sacrilegio, Andreas ordina a Frodi di ucciderla, ma il cavaliere si rifiuta di farlo, e quando Andreas tenta di mandarlo in Berserk come già aveva fatto con Sigmund Frodi distrugge lo zaffiro con la propria spada, liberandosi dall'influsso di Andreas. All'improvviso appare Utgard, che colpisce mortalmente Lithia. La giovane spira tra le braccia del disperato Ioria. Frodi affronta Utgard per vendicare la sua amica d'infanzia, esortando Ioria a cercare e affrontare Andreas.

Come ha promesso a Lyfia, Ioria finalmente affronta Andreas. Andreas dice a Ioria che la vita di Lyfia è stata quella di una marionetta e zombie nelle mani di andreas. Ioria colmo di rabbia usa un poderoso cosmo per arrivare all'armatura divina lanciando il Lighting Plasma. Nel frattempo Froidl è impegnato nella battaglia contro Utgard e subisce colpi su colpi dalla spada di Utgard, che assume una strana posizione difensiva. Nel mezzo dei dubbi Froidl ricorda la sua risolutezza nel proteggere Asgard percependo la voce della sua terra.

Mur, Saga e Dohko scagliano la tecnica proibita Urlo di Atena vestendo le armature divine e riescono in questo modo a sconfiggere Andreas. Eppure il frutto del male non sembra fermare la sua crescita e Ioria e gli altri cavalieri vengono catturati dalle radici dell'Yggdrasil. Dinnanzi a Ioria, in qualche modo scampato alla cattura, si palesa l'armatura di Loki. I cavalieri d'oro hanno sì disintegrato il corpo della divinità, ma la vera essenza di Loki era rimasta intatta, nascosta nella sua armatura. Privato dell'armatura d'oro, Ioria si trova ad affrontare Loki in una situazione ormai disperata. Ormai sul punto di perire sotto i colpi del dio a cui ogni resistenza risulta vana, il cavaliere viene salvato da un inaspettato miracolo.

Con rinnovato coraggio dovuto alla volontà del fratello Micene e forte dell'armatura di Odino ottenuta da Lithia, Ioria si confronta con Loki impugnando la spada dello stesso Odino e il tesoro reale Draupnir! Grazie alla forza combinata di Ioria e Lithia, Loki comincia ora a trovarsi alle strette. Tuttavia la giovane Lithia, appena divenuta vicario del dio Odino, non sembra ancora in grado di sostenerne l'incredibile forza. La situazione è resa ancora più critica dalla lenta ma inesorabile crescita della lancia Gungnir, e dalla sua imminente rinascita! La guerra raggiunge il suo culmine: riusciranno i colpi di Ioria ad avere la meglio contro la lancia Gungnir in questo scontro mortale?

I cavalieri d'oro sono di nuovo riuniti dopo la distruzione del Muro del pianto e si preparano a sfidare il dio degli inganni Loki armato della Lancia Gungnir. I dodici cavalieri si trovano però sovrastati dalla schiacciante potenza del dio. Nonostante la situazione sia ormai disperata, Lithia non si dà per vinta e continua a supportare i dodici tramite le sue preghiere. In quel momento, come in risposta all'armonia creatasi nel firmamento, una rivelazione di Atena discende dai cieli. Per proteggere la pace e la giustizia sulla Terra Ioria e gli altri cavalieri d'oro dovranno sconfiggere il dio degli inganni Loki, superando con il loro cosmo quello di una divinità.